Jan Hrušínský se narodil jako mladší syn legendárního českého herce Rudolfa Hrušínského. Na jevišti stál poprvé už v pěti letech. Po absolvování Pražské konzervatoře zahájil svou profesionální kariéru v Činoherním studiu v Ústí nad Labem. Následně působil v Realistickém divadle v Praze, krátce v Divadle Na zábradlí, a spolupracoval také s divadly Rokoko, Divadlem v Řeznické a Divadlem ABC.
V roce 2004 navázal na rodinnou divadelní tradici a založil vlastní scénu – Divadlo Na Jezerce, kde působí jako principál.
Na filmovém plátně se poprvé objevil v dětském věku jako Orlík ve filmu Babička, o rok později ztvárnil hlavní roli v pohádce Dívka na koštěti. V 70. letech se stal populární díky sérii filmů Můj brácha má prima bráchu a Brácha za všechny peníze. Diváci si ho oblíbili také jako prince ve známé pohádce Jak se budí princezny a výraznou roli ztvárnil i jako Pepan ve filmu Lásky mezi kapkami deště režiséra Karla Kachyni.
Kromě herectví se věnuje i režii a fotografii. Je známý svým občanským angažmá a veřejným vystupováním k aktuálním společenským otázkám.